A Guerra dos Treze Anos, foi um conflito que ocorreu entre 1454 e 1466, envolvendo a Confederação Prussiana, aliada ao Reino da Polônia, contra o Estado da Ordem Teutônica.
O conflito começou como uma insurreição das cidades prussianas e da nobreza local, que buscavam a independência dos Cavaleiros Teutônicos. Em 1454, Casimiro IV da Polônia se casou com Elizabeth da Áustria e a Confederação Prussiana solicitou ajuda ao rei polonês, oferecendo-se para aceitá-lo como protetor em lugar da Ordem Teutônica. Quando Casimiro IV aceitou a proposta, a guerra eclodiu entre os aliados da Confederação Prussiana, apoiados pela Polônia, e os defensores do governo dos Cavaleiros Teutônicos.
A guerra terminou com a vitória da Confederação Prussiana e da Polônia, formalizada pela Segunda Paz de Toruń em 1466. Logo após, eclodiu a Guerra dos Sacerdotes (1467–1479), uma prolongada disputa pela independência do Príncipe-Bispado Prussiano de Warmia, durante a qual os Cavaleiros tentaram revisar os termos da Paz de Toruń.